Đoàn Quan trắc tài nguyên nước miền Bắc là đơn vị trực thuộc Liên đoàn Quy hoạch và Điều tra tài nguyên nước miền Bắc, có chức năng giúp Liên đoàn trưởng quản lý, tổ chức thực hiện nhiệm vụ quan trắc, giám sát tài nguyên nước trên địa bàn các tỉnh Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ (gọi tắt là các tỉnh miền Bắc); thực hiện các hoạt động tư vấn, dịch vụ trong lĩnh vực tài nguyên nước theo quy định của pháp luật.